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자폐 스펙트럼 장애 또는 조현병

HLA-DRB1 · rs142972412

근거 강도

1 / 4

유전 연구에서 가장 강한 결과는 p = 10−12, GWAS Catalog에 연관 1건이 보고됨.

점수를 매기는 방법

4: ClinVar 질환 원인 판정, 전문가 패널·진료 지침 검토(별 3–4개). 3: ClinVar 판정, 여러 기관 일치(별 2개), 또는 유전 연구 p ≤ 10−50. 2: ClinVar 판정, 한 기관(별 1개), 또는 p ≤ 10−20. 1: 기준 없이 제출된 ClinVar 판정(별 0개), 또는 게놈 전체 수준 유의(p ≤ 5×10−8). 둘 중 높은 쪽을 씁니다. 근거가 얼마나 단단한지만 말하며, 특정한 사람에게 중요한지는 말하지 않습니다.

연구가 보고한 것

연구 대상 schizophrenia cases and controls (see Ripke, 2014), up to 6,197 European ancestry ASD cases, up to 7,377 European ancestry controls, up to 1,190 ASD cases, up to 1,190 controls.

효과 T 대립유전자 한 개당 자폐 스펙트럼 장애 또는 조현병의 오즈가 1.09배(95% 신뢰구간 1.06-1.12); p = 1 × 10−12.

위치 6번 염색체 6p21.32, 유전자 사이, HLA-DRB9에서 13.6 kb 떨어져 있습니다.

이 위치의 각 버전은 얼마나 흔한가

CT
한국인 KRGDB
C 37.4% · T 62.6%
한국인 Korea4K
C 50.5% · T 49.5%
일본인 ToMMo
C 37.3% · T 62.7%
전 세계 gnomAD
C 58.2% · T 41.8%
전 세계 1000 Genomes
C 68.2% · T 31.9%

조상 집단별 gnomAD

동아시아계
C 50.2% · T 49.8%
유럽계(핀란드 제외)
C 55.5% · T 44.5%
아프리카계
C 65.5% · T 34.5%
남아시아계
C 49.4% · T 50.6%
아메리카 혼합계(라틴계)
C 58.0% · T 42.0%
중동계
C 70.0% · T 30.0%
핀란드계
C 50.5% · T 49.5%
아슈케나지 유대계
C 65.4% · T 34.6%

한 사람이 가진 두 벌 가운데 각 버전이 차지하는 비율입니다. 출처: dbSNP(미국 NCBI)에 공개된 집단 연구 — 각 줄에 연구 이름을 적었습니다. 조상 집단별 줄은 gnomAD(Ensembl 경유)의 집단 구분이며, 인종 구분이 아닙니다.

각 결과의 의미

C/C 연구에서 자폐 스펙트럼 장애 또는 조현병 항목과 연결된 버전이 하나도 없습니다. 연구가 모두를 비교한 출발점입니다.
C/T 연구에서 자폐 스펙트럼 장애 또는 조현병 항목과 연결된 버전이 하나 있습니다. 두 개일 때보다 연결이 약합니다.
T/T 연구에서 자폐 스펙트럼 장애 또는 조현병 항목과 연결된 버전이 두 개 있습니다. 세 결과 가운데 연결이 가장 강합니다. 연구에서의 연결은 진단이 아닙니다.
출처

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자폐 스펙트럼 장애 또는 조현병 (rs142972412). MyGeneLog™. https://www.mygenelog.com/ko/variants/rs142972412

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