건선

TNFAIP3 · rs582757

아직 분석된 연결 정보가 부족합니다. 이 위치를 다루는 질환·약물·감각 페이지가 아직 없다는 뜻입니다. 하지만 이 페이지에 필요한 건 다 있습니다. 연구가 무엇을 찾았는지, 유전형마다 무슨 뜻인지, 그 근거가 어디서 왔는지를 위에 적어 두었습니다. 관련 페이지를 쓰게 되면 링크는 저절로 붙습니다.

근거 강도

2 / 4

유전 연구에서 가장 강한 결과는 p = 10⁻²⁵, GWAS Catalog에 연관 7건이 보고됨.

점수를 매기는 방법

4: ClinVar 질환 원인 판정, 전문가 패널·진료 지침 검토(별 3–4개). 3: ClinVar 판정, 여러 기관 일치(별 2개), 또는 유전 연구 p ≤ 10⁻⁵⁰. 2: ClinVar 판정, 한 기관(별 1개), 또는 p ≤ 10⁻²⁰. 1: 기준 없이 제출된 ClinVar 판정(별 0개), 또는 게놈 전체 수준 유의(p ≤ 5×10⁻⁸). 둘 중 높은 쪽을 씁니다. 근거가 얼마나 단단한지만 말하며, 특정한 사람에게 중요한지는 말하지 않습니다.

연구가 보고한 것

연구 대상 유럽계 환자 10,588명, 유럽계 대조군 22,806명.

효과 보고된 대립유전자는 C이고, 효과 크기는 목록에 기재되지 않음 ; p = 2 × 10⁻²⁵.

빈도 연구 대상에서 C 대립유전자의 빈도는 약 27%였습니다.

위치 6번 염색체 6q23.3, TNFAIP3의 인트론에 있습니다.

이 위치의 각 버전은 얼마나 흔한가

CT

조상 집단별 gnomAD

동아시아계

C 9.1% · T 90.9%

유럽계(핀란드 제외)

C 27.4% · T 72.6%

아프리카계

C 34.7% · T 65.3%

남아시아계

C 24.1% · T 75.9%

아메리카 혼합계(라틴계)

C 27.4% · T 72.6%

중동계

C 28.6% · T 71.4%

핀란드계

C 32.7% · T 67.3%

아슈케나지 유대계

C 31.0% · T 69.0%

한 사람이 가진 두 벌 가운데 각 버전이 차지하는 비율입니다. 조상 집단별 줄은 gnomAD(Ensembl 경유)의 집단 구분이며, 인종 구분이 아닙니다.

각 결과의 의미

C/C 연구에서 건선 항목과 연결된 버전이 두 개 있습니다. 세 결과 가운데 연결이 가장 강합니다. 연구에서의 연결은 진단이 아닙니다.

C/T 연구에서 건선 항목과 연결된 버전이 하나 있습니다. 두 개일 때보다 연결이 약합니다.

T/T 연구에서 건선 항목과 연결된 버전이 하나도 없습니다. 연구가 모두를 비교한 출발점입니다.

DNA 데이터베이스에는 이 위치의 세 번째 드문 형태도 기록되어 있지만, DNA 사본 백 개 중 하나도 되지 않습니다. 위의 세 가지 결과는 흔한 두 형태만 다룹니다.

출처

Identification of 15 new psoriasis susceptibility loci highlights the role of innate immunity

Tsoi LC, Spain SL, Knight J, Ellinghaus E, Stuart PE, Capon F, Ding J, Li Y, Tejasvi T, Gudjonsson JE, Kang HM, Allen MH

외 53명 — 모두 보기

Collaborative Association Study of Psoriasis (CASP) · Genetic Analysis of Psoriasis Consortium · Psoriasis Association Genetics Extension · Wellcome Trust Case Control Consortium 2

Nature genetics · 2012 · PMID 23143594 · 오픈 액세스

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