장내 미생물총 (세균 분류군)

LINGO2 · rs10969143

아직 분석된 연결 정보가 부족합니다. 이 위치를 다루는 질환·약물·감각 페이지가 아직 없다는 뜻입니다. 하지만 이 페이지에 필요한 건 다 있습니다. 연구가 무엇을 찾았는지, 유전형마다 무슨 뜻인지, 그 근거가 어디서 왔는지를 위에 적어 두었습니다. 관련 페이지를 쓰게 되면 링크는 저절로 붙습니다.

근거 강도

1 / 4

유전 연구에서 가장 강한 결과는 p = 10⁻⁸, GWAS Catalog에 연관 1건이 보고됨.

점수를 매기는 방법

4: ClinVar 질환 원인 판정, 전문가 패널·진료 지침 검토(별 3–4개). 3: ClinVar 판정, 여러 기관 일치(별 2개), 또는 유전 연구 p ≤ 10⁻⁵⁰. 2: ClinVar 판정, 한 기관(별 1개), 또는 p ≤ 10⁻²⁰. 1: 기준 없이 제출된 ClinVar 판정(별 0개), 또는 게놈 전체 수준 유의(p ≤ 5×10⁻⁸). 둘 중 높은 쪽을 씁니다. 근거가 얼마나 단단한지만 말하며, 특정한 사람에게 중요한지는 말하지 않습니다.

연구가 보고한 것

연구 대상 유럽계 984명; 재현은 유럽계 530명.

효과 A 대립유전자 한 개당 측정값이 5.53 Z-score만큼 높음; p = 3 × 10⁻⁸.

위치 9번 염색체 9p21.1, 유전자 사이, PDK1P1에서 95.4 kb 떨어져 있습니다.

이 위치의 각 버전은 얼마나 흔한가

AG

한국인 KRGDB

A 49.1% · G 50.8%

한국인 Korea4K

A 47.6% · G 52.4%

일본인 ToMMo

A 42.2% · G 57.8%

베트남인

A 47.2% · G 52.8%

전 세계 gnomAD

A 45.0% · G 55.0%

전 세계 1000 Genomes

A 46.4% · G 53.6%

전 세계 TOPMed

A 45.1% · G 54.9%

조상 집단별 gnomAD

동아시아계

A 46.9% · G 53.1%

유럽계(핀란드 제외)

A 46.0% · G 54.0%

아프리카계

A 41.1% · G 58.9%

남아시아계

A 43.8% · G 56.2%

아메리카 혼합계(라틴계)

A 47.9% · G 52.1%

중동계

A 40.5% · G 59.5%

핀란드계

A 50.7% · G 49.3%

아슈케나지 유대계

A 43.0% · G 57.0%

한 사람이 가진 두 벌 가운데 각 버전이 차지하는 비율입니다. 출처: dbSNP(미국 NCBI)에 공개된 집단 연구 — 각 줄에 연구 이름을 적었습니다. 조상 집단별 줄은 gnomAD(Ensembl 경유)의 집단 구분이며, 인종 구분이 아닙니다.

각 결과의 의미

A/A 연구에서 장내 미생물총 (세균 분류군) 항목과 연결된 버전이 두 개 있습니다. 세 결과 가운데 연결이 가장 강합니다. 연구에서의 연결은 진단이 아닙니다.

A/G 연구에서 장내 미생물총 (세균 분류군) 항목과 연결된 버전이 하나 있습니다. 두 개일 때보다 연결이 약합니다.

G/G 연구에서 장내 미생물총 (세균 분류군) 항목과 연결된 버전이 하나도 없습니다. 연구가 모두를 비교한 출발점입니다.

출처

The effect of host genetics on the gut microbiome

Bonder MJ, Kurilshikov A, Tigchelaar EF, Mujagic Z, Imhann F, Vila AV, Deelen P, Vatanen T, Schirmer M, Smeekens SP, Zhernakova DV, Jankipersadsing SA

외 18명 — 모두 보기

Jaeger M, Oosting M, Cenit MC, Masclee AA, Swertz MA, Li Y, Kumar V, Joosten L, Harmsen H, Weersma RK, Franke L, Hofker MH, Xavier RJ, Jonkers D, Netea MG, Wijmenga C, Fu J, Zhernakova A

Nature genetics · 2016 · PMID 27694959

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