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파제트병

CSF1 · rs10494112

근거 강도

2 / 4

유전 연구에서 가장 강한 결과는 p = 10−34, GWAS Catalog에 연관 1건이 보고됨.

점수를 매기는 방법

4: ClinVar 질환 원인 판정, 전문가 패널·진료 지침 검토(별 3–4개). 3: ClinVar 판정, 여러 기관 일치(별 2개), 또는 유전 연구 p ≤ 10−50. 2: ClinVar 판정, 한 기관(별 1개), 또는 p ≤ 10−20. 1: 기준 없이 제출된 ClinVar 판정(별 0개), 또는 게놈 전체 수준 유의(p ≤ 5×10−8). 둘 중 높은 쪽을 씁니다. 근거가 얼마나 단단한지만 말하며, 특정한 사람에게 중요한지는 말하지 않습니다.

연구가 보고한 것

연구 대상 유럽계 환자 741명, 유럽계 대조군 2,699명; 재현은 유럽계 환자 1,474명, 유럽계 대조군 1,671명.

효과 G 대립유전자 한 개당 파제트병의 오즈가 1.72배(95% 신뢰구간 1.57-1.87); p = 7 × 10−35.

빈도 연구 대상에서 G 대립유전자의 빈도는 약 20%였습니다.

위치 1번 염색체 1p13.3, NDUFA5P10 안에 있습니다.

이 위치의 각 버전은 얼마나 흔한가

AG
한국인 KRGDB
A 99.9% · G 0.1%
한국인 Korea4K
A 99.9% · G 0.1%
한국인 Korea1K
A 100.0% · G 0.1%
일본인 ToMMo
A 100.0% · G 0.0%
베트남인
A 99.5% · G 0.5%
전 세계 gnomAD
A 83.0% · G 17.0%
전 세계 1000 Genomes
A 88.7% · G 11.3%
전 세계 TOPMed
A 84.0% · G 16.0%

조상 집단별 gnomAD

동아시아계
A 99.9%
유럽계(핀란드 제외)
A 79.0% · G 21.0%
아프리카계
A 87.3% · G 12.7%
남아시아계
A 85.3% · G 14.7%
아메리카 혼합계(라틴계)
A 87.8% · G 12.2%
중동계
A 81.0% · G 19.1%
핀란드계
A 75.7% · G 24.3%
아슈케나지 유대계
A 80.2% · G 19.8%

한 사람이 가진 두 벌 가운데 각 버전이 차지하는 비율입니다. 출처: dbSNP(미국 NCBI)에 공개된 집단 연구 — 각 줄에 연구 이름을 적었습니다. 조상 집단별 줄은 gnomAD(Ensembl 경유)의 집단 구분이며, 인종 구분이 아닙니다.

각 결과의 의미

A/A 연구에서 파제트병 항목과 연결된 버전이 하나도 없습니다. 연구가 모두를 비교한 출발점입니다.
A/G 연구에서 파제트병 항목과 연결된 버전이 하나 있습니다. 두 개일 때보다 연결이 약합니다.
G/G 연구에서 파제트병 항목과 연결된 버전이 두 개 있습니다. 세 결과 가운데 연결이 가장 강합니다. 연구에서의 연결은 진단이 아닙니다.
출처

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파제트병 (rs10494112). MyGeneLog™. https://www.mygenelog.com/ko/variants/rs10494112

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