두 집단에서 두 번 찾았는데, 두 답 사이에 겹치는 것이 거의 없었습니다. 그것이 이 페이지의 발견이고 — 한 곳에서만 연구된 병을 두고 "이 병의 유전학"이라고 말할 때 그것이 무슨 뜻인지에 대한 수업입니다.
백반증은 면역계가 색소를 만드는 세포인 멜라닌세포를 파괴하는 자가면역질환입니다. 그 결과 피부와 털에서 색이 빠진 부분이 생깁니다. 위험한 병도, 옮는 병도 아니며, 다른 자가면역질환의 위험이 높아집니다.
2010년, 전신 백반증에 대한 유전체 전장 연구 두 편이 몇 달 사이로, 서로 다른 집단에서 발표되었습니다.
하나는 중국 한족 참가자를 보았습니다. 환자 1,117명과 대조군 1,429명, 그리고 환자 5,910명과 대조군 9,916명에 중국 위구르족 713명과 824명을 더한 반복 검증까지. MHC 안에서 독립적인 신호 두 개와 6q27의 좌위 하나를 찾았습니다.
다른 하나는 유럽계 환자를 보았습니다. 환자 1,514명 대 대조군 2,813명, 위치 579,146개, 반복 검증 집단 두 개. 자가면역 좌위들과 함께 TYR의 변이를 찾았습니다 — 색소를 만드는 효소인 티로시나아제의 유전자입니다.
두 답은 같은 병치고는 훨씬 덜 겹칩니다.
한쪽이 틀렸다는 뜻이 아닙니다. 둘 다 규모가 컸고 둘 다 반복 검증되었습니다.
"백반증의 유전학"이라는 말이 질문 하나를 감추고 있다는 뜻입니다. 누구의 유전학인가. 집단마다 어떤 변이가 흔한지가 다르고, 어떤 대립유전자들이 염색체에서 나란히 붙어 다니는지가 다르며, 때로는 그 병으로 가는 어떤 경로가 아예 있는지 없는지도 다릅니다. 스캔은 자기가 본 사람들 안에서 변하는 것을 찾습니다.
이것은 일반적인 문제이고 백반증은 유난히 분명한 사례입니다. 유전체 전장 연구의 압도적 다수가 유럽계 코호트에서 이루어졌고, 그 전부가 인쇄되어 있든 아니든 이 단서를 달고 있습니다.
유럽 연구의 TYR 발견은 따로 한 문단을 쓸 값어치가 있습니다. 이상하고, 또 말이 되기 때문입니다.
티로시나아제는 면역 단백질이 아닙니다 — 멜라닌세포가 색소를 만들 때 쓰는 효소입니다. 그것이 여기 나타났다는 것은 면역계가 멜라닌세포를 아무렇게나 공격하고 있는 것이 아니라는 말입니다. 멜라닌세포가 만드는 특정한 무언가를 알아보고 있는 것이죠. 표적은 색소 기계 자체입니다.
백반증은 피부를 보고, 때로 우드등을 써서 진단합니다. 유전형은 쓰이지 않고, 이 위치들 가운데 누가 발병할지 예측하는 것은 없으며, 치료도 이들에 달려 있지 않습니다.
두 출처. Quan 등(Nat Genet 2010)은 중국 한족 집단에서 전신 백반증의 유전체 전장 연관 연구를 수행해 환자 1,117명과 대조군 1,429명을 유전형 분석하고, 가장 유망한 SNP 34개를 중국 한족 환자 5,910명과 대조군 9,916명, 그리고 중국 위구르족 환자 713명과 대조군 824명으로 가져갔습니다. MHC 안에서 독립적인 연관 신호 두 개(rs11966200, 통합 P 1.48e-48, OR 1.90; rs9468925, 통합 P 2.21e-33, OR 0.74)와 6q27 좌위가 확인되었습니다. Jin 등(NEJM 2010)은 유럽계 환자 1,514명에서 SNP 579,146개를 공개된 대조군 2,813명과 비교해 유전형 분석하고, SNP 50개를 두 개의 반복 검증 집단에서 검사해 자가면역 감수성 좌위들과 함께 TYR의 변이를 보고했습니다.
여기 기록된 변이. 중국 한족 연구에서 나온 6q27 RNASET2 근처의 rs2236313, 그리고 유럽 연구에서 나온 UBASH3A의 rs11203203. UBASH3A는 1형 당뇨병 및 셀리악병과도 연관되며, 이는 전신 백반증이 다른 자가면역질환과 함께 나타나는 잘 알려진 양상과 맞습니다.
TYR 발견. 티로시나아제는 멜라닌 합성의 속도 결정 효소이며 백반증에서 알려진 자가항원입니다. 그것이 감수성 좌위로 확인된 것은 비특이적이 아니라 항원 특이적인 자가면역 과정을 뒷받침하며, GWAS가 면역 기계만이 아니라 자가면역의 표적을 지목한 드문 사례입니다.
임상적 경계. 전신 백반증은 임상적으로 진단하며, 다른 탈색소 질환과의 구분이 불분명할 때 우드등 검사를 씁니다. 유전형은 진단, 예후, 치료 선택에 기여하지 않습니다. 다른 자가면역질환 — 특히 갑상선 질환 — 과의 연관은 임상적으로 중요하지만, 그것은 병력 청취와 갑상선 기능 검사로 평가하지 유전형으로 하지 않습니다.
23andMe·AncestryDNA 내보내기 파일이나 원본 VCF가 백반증에 대해 무엇을 알려줄 수 있고 없는지는 아래의 잘 연구된 특정 위치들로 정해집니다. 진단이 아닙니다.
서로 다른 집단을 보았기 때문이고, 집단마다 어떤 변이가 흔한지와 어떤 대립유전자들이 붙어 다니는지가 다르기 때문입니다. 어느 쪽도 틀리지 않았습니다. "백반증의 유전학"이라는 말이 누구의 것이냐는 질문을 감추고 있다는 뜻이고 — 거의 모든 유전체 전장 연구가 인쇄되어 있든 아니든 그 단서를 달고 있습니다.
면역계가 알아보고 있는 것이 바로 그것이기 때문입니다. 티로시나아제는 멜라닌세포가 색소를 만들 때 쓰는 효소이고, 그것이 여기서 나왔다는 것은 공격이 아무렇게나 이루어지는 것이 아니라 그 세포가 만드는 특정한 무언가를 겨냥하고 있다는 말입니다.
위험이 올라가고, 흔한 것은 갑상선 질환입니다. 의사에게 말해 둘 만하고, 혈액검사로 확인합니다. 여기 있는 유전자 몇 개가 1형 당뇨병·셀리악병과 공유되는데, 같은 사실을 유전체 쪽에서 본 것입니다.
아닙니다. 피부를 보고, 때로 우드등을 써서 진단합니다. 여기 있는 어떤 위치도 누가 발병할지 예측하지 않고 치료에도 영향을 주지 않습니다.